Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Msl2Q69ZF8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Msl2Q69ZF8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Msl2Q69ZF8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms