Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrcc1Q69ZB0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms