Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms