Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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