Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms