Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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