Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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