Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf3Q60765 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atf3Q60765 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms