Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sin3aQ60520 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms