Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Utp20Q5XG71 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms