Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim38Q5SZ99 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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