Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms