Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Rtl5Q5DTT4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtl5Q5DTT4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Rtl5Q5DTT4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rtl5Q5DTT4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rtl5Q5DTT4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rtl5Q5DTT4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rtl5Q5DTT4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Rtl5Q5DTT4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Rtl5Q5DTT4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Rtl5Q5DTT4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtl5Q5DTT4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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