Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc43Q3V0L5 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms