Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrfip1Q3UZ39 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms