Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Znf48Q3US17 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Znf48Q3US17 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Znf48Q3US17 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Znf48Q3US17 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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