Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms