Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp30Q3UN04 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp30Q3UN04 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp30Q3UN04 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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