Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Edc4Q3UJB9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms