Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms