Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Rnf180Q3U827 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnf180Q3U827 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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