Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Q3U6N9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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