Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LcorlQ3U285 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms