Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc9Q3U0M1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms