Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbc1d2bQ3U0J8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms