Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Srsf6Q3TWW8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms