Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccndbp1Q3TVC7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms