Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RubcnlQ3TD16 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms