Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Hddc2Q3SXD3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms