Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbtb38Q3LR78 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms