Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nlrp1aQ2LKU9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms