Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam178bQ24JP3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Fam178bQ24JP3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fam178bQ24JP3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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