Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim71Q1PSW8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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