Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cers3Q1A3B0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cers3Q1A3B0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms