Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ptcd3Q14C51 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms