Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd2Q149F1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms