Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

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Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc162pQ0VG85 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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