Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc39dQ0VF76 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms