Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rab42Q0PD08 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms