Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms