Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pate4Q09098 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pate4Q09098 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms