Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgm3Q08189 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms