Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cntn3Q07409 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms