Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prrx2Q06348 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Prrx2Q06348 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms