Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Apoc2Q05020 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms