Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox12Q04890 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms