Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms