Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccl7Q03366 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms