Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Runx1Q03347 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Runx1Q03347 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms