Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RykQ01887 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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RykQ01887 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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RykQ01887 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RykQ01887 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RykQ01887 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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RykQ01887 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RykQ01887 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms